、DNA甲基化 CpG Islands(rb gene) 频 率 AAA、M Rb基因 3′ 令CpG岛主要处于基因5′端调控区域 ☆启动子区域的cpG岛一般是非甲基化状态的,其非甲基 化状态对相关基因的转录是必须的 ☆目前认为基因调控元件(如启动子)的CpG岛中发生 5mc修饰会在空间上阻碍转录因子复合物与DNA的结 合。因而DNA甲基化一般与基因沉默相关联。 2021年12月23日 16
2021年12月23日 16 一、DNA甲基化 2021年12月23日 16 5’ 3’ ❖ CpG岛主要处于基因5’端调控区域。 ❖ 启动子区域的CpG岛一般是非甲基化状态的,其非甲基 化状态对相关基因的转录是必须的。 ❖ 目前认为基因调控元件(如启动子)的CpG岛中发生 5mC修饰会在空间上阻碍转录因子复合物与DNA的结 合。因而DNA甲基化一般与基因沉默相关联。 Rb基因 CpG 频 率
以基因型为a/a的母鼠 及其孕育的基因型为 AVY/a的仔鼠作实验对象。 孕鼠分为两组,试验组孕 鼠除喂以标准饲料外,从 受孕前两周起还增加富含 甲基的叶酸、乙酰胆碱等 补充饲料,而对照组孕鼠 只喂饲标准饲料 结果实验组孕鼠产下的仔鼠大多数在身体的不同部位出现了大小不等的棕 色斑块,甚至出现了以棕褐色为主要毛色的小鼠。而对照组孕鼠的仔鼠大多数 为黄色。分析表明喂以富甲基饲料的孕鼠所产仔鼠的IAP所含CpG岛的甲基化 平均水平远高于对照组,转录调控区的高甲基化使原该呈异位表达的基因趋于 沉默,毛色也趋于棕褐色
以基因型为a/a的母鼠 及 其 孕 育 的 基 因 型 为 AVY/a的仔鼠作实验对象。 孕鼠分为两组,试验组孕 鼠除喂以标准饲料外,从 受孕前两周起还增加富含 甲基的叶酸、乙酰胆碱等 补充饲料,而对照组孕鼠 只喂饲标准饲料。 结果实验组孕鼠产下的仔鼠大多数在身体的不同部位出现了大小不等的棕 色斑块,甚至出现了以棕褐色为主要毛色的小鼠。而对照组孕鼠的仔鼠大多数 为黄色。分析表明喂以富甲基饲料的孕鼠所产仔鼠的IAP所含CpG岛的甲基化 平均水平远高于对照组,转录调控区的高甲基化使原该呈异位表达的基因趋于 沉默,毛色也趋于棕褐色
、DNA甲基化 Oligl CpG预测 (1)lilab(http://www.urogene.org/cgi-bin/methprimer/methprimer.cgi) 座导 && 0 500bp 1000如 1500b CpGII I I II P11111111 (2) methprimer软件预测 2U00 5 H++++++++H++++普+H++++HHd 14552000
Olig1 CpG预测 一、DNA甲基化 (1)Li lab (http://www.urogene.org/cgi-bin/methprimer/methprimer.cgi) (2)methprimer软件预测
、DNA甲基化 (3)http://www.uscnorris.com/cpgislands2/cpg.aspx 800 1600 1601 2000 G island 1 CpG Island 1(1745-2000bp
(3)http://www.uscnorris.com/cpgislands2/cpg.aspx CpG Island 1 (1745 – 2000bp) 一、DNA甲基化
、DNA甲基化 BSP实验检测Oig1启动子区甲基化变化: 下 1bp +H"H2000bp 14:6200 NSCs ●●●●● 88:8 21.1% ●●●● e88:88888:88 0891.9% Quantificationtoolformethylationanalysis(http://quma.cdbrikenip/)
21.1% OPCs 1bp 2000bp NSCs 1.9% 一、DNA甲基化 BSP实验检测Olig1启动子区甲基化变化: Quantification tool for methylation analysis(http://quma.cdb.riken.jp/)