• Protein Structure Prediction & Alignment (蛋白质结构预测&比对) • Molecular Dynamics Simulation (分子动力学模拟) • Protein-protein interaction prediction (蛋白质-蛋白质相互作用预测) 蛋白质结构比较 • Global versus local alignment（全局和局部比对） • Measuring protein similarity（结构相似度评估） • Protein structure superposition（结构叠合） • Protein structure alignment（结构比对）

1 基因组序列特征分析  碱基组成分析  序列模体分析  密码子使用偏嗜性分析  重复序列分析  限制性酶切位点分析  基因识别 2 基因功能分析 3 基因组比较 基因组比较  基因组比较：将一个基因组（全部序列、预测的所有基因或蛋白质）与其自身（物种内）或其它的基因组（物种间）进行比较。  对不同物种的基因组进行比较分析，帮助我们理解基因组间的相似性、基因组的进化及其基因的进化历程 基因组内比较 vs 基因组间比较

什么是生物信息学？ 生物信息在哪儿？ 细胞 分子 存贮、复制、传递和表达 遗传信息的系统 生物信息的载体 DNA RNA Protein Phenotype 生物信息学的发展背景 生物信息学的研究内容 我校生物信息学的平台简介

1 双序列比对介绍 2 BLAST的基本原理 3 BLAST应用 4 序列相似度聚类  人的BIRC5基因编码的蛋白质包含142个氨基酸，序列标识符为：NP_001159.2  BIRC5具有保守的功能结构域BIR 主要功能：caspase酶的抑制因子

生命科学的核心问题： 生命是什么？ 终极问题,最后Boss 一个 DNA （Gene）---- Gain/lost of function 多个或一组 DNA （Genes/ genome）----系统，网络 合成生物？ 干细胞组织工程？克隆动物（人）？ 肿瘤，转基因动物（绿色荧光小鼠），遗传病 DNA is very important ! • DNA的碱基排列（ATGC）顺序（sequence） 储存着遗传信息，进而决定物种性状； • 人的核内DNA有3X10^9个碱基对，以23对染 色体形式存在。 Decoding the genome: classical methods and ideas Mapping open chromatin in cd28/ctl4/icos locus region during T cells activation

一、基因组进化的分子基础 二、基因组的进化模式 The mode of Genome evolution I. The Origin of Genome II. The Origin of New Genes III. The Evolution of New Genes 基因组进化的分子基础 突变（mutation） 重组（recombination) 转座(transposition) III. 新基因的进化（Evolution of new genes ）

1、细胞社会性 Cell sociology 2.细胞信号转导 Signal transduction ◼ 蛋白质（激酶）活性的测定 3、细胞衰老 4、细胞死亡及其研究现状 Normal cell Necrotic cell Apoptotic cell 5、细胞凋亡

1.The charactaristics of life and cells are the basic unit of life 2.Regulation of cell activity 3.Cell Cycle

⚫ 硕士研究生的目标? ⚫ 硕士研究生工作、学习特性？应具备怎样的素质？ ⚫ 你欠缺什么？ 目标：  学术型研究生硕士教育：以培养教学和科研人才为主的研究生教育，侧重于理论教育，以大学教师，科研机构的研究人员为主要目标。  所有学术型研究生毕业均拥有学历、学位双证初步具备独立开展科学研究的能力

➢（一）脑活动概述 ➢（二）神经环路活动：实现脑功能活动的保证 ➢（三）神经环路活动的细胞分子基础——神经元、突触、环路整合 ➢（四）举例：基底神经节环路活动中黑质-纹状体通路机制的研究进展和前沿