一、什么是系统生物学? 二、什么是生物系统? 三、系统生物学的研究内容 四、系统生物学的技术和方法 五、系统组学(Systeome) 六、癌的系统生物学 七、系统生物学对医学的影响 八、小结

微生物( microorganism, microbe)是一切肉眼看不见或看不清楚的微小生物的总称。它们 是一些个体微小(<0.1mm)、构造简单的低等生物,包括属于原核类的细菌、放线菌、支原 体、立克次氏体、衣原体和蓝细菌(过去称藍藻或蓝绿藻),属于真核类的真菌(酵母菌和霉 菌)、原生动物和显微藻类,以及属于非细胞类的病毒、类病毒和朊病毒等。现表解如下 小(个体小){um(徽米)级:光学显微镜下可见《细胞 nm〔纳米)级:电于显微镜下可见(细胞器,病毒) 单细胞 简(构造简单)〈简单多细胞 非细胞(即“分子生物”) 原核类:细菌,放线菌,支原体,立克次氏体,衣原体,蓝细菌 低(进化地位低){真核类:真茵(酵母曹,霉菌),原生动物

美国国家生物技术信息中心( National Center for biotechnology Information fa] 称NCBI)创建于1988年。 1991年,NCB|开发了 Entrez数据库查询系 统,用于对 Gen Bank等分子生物学和生物 医学文献摘要( Medline)等数据库的査询 ( Schuler et al,1996)

数据库(Database) 用于收集、整理、储存、加工、发布 和检索数据的系统。 生物类的数据库种类很多， 投稿文章首先要将核苷酸序列或蛋白， 质序列提交到相应的数据库中

生物信息学现状和重要研究方向 1.1什么是生物信息学? Genome informatics is a scientific discipline that encompasses all aspects of genome information acquisition, processing, storage, distribution, analysis, and interpretation. 它是一个学科领域,包含着基因组信息的获取、处 理、存储、分配、分析和解释的所有方面

Systems Biology x Network Biology GOAL: develop a quantitative understanding of the biological function of genetic and biochemical networks INPUT

I Systems Microbiology(13 Lectures 7hece∥ as a we∥}- stirred boc/ nem/ca/ reactor Introduction 2 Chemical kinetics, Equilibrium binding, cooperativity L3 Lambda phage L4 Stability analysis L5-6 Genetic switches

Note final ps For question 2(a)the value of k'in the final equation(Eq 3b) needs to be rescaled Tuesday lecture will be for questions on the last problem set Juan)

Alternative views on gradient sensing Postma and van hastert. 'a diffusion-translocation model for gradient sensing by chemotactic cells Biophys.J.81,1314(2001) Levchenko and Iglesias. Models of eukaryotic gradient sensing: applications to chemotaxis of amoeba and neutrophils

Review L15 Turing-Gierer-Meinhardt models Local excitation, global inhibition