琼脂糖是从海藻中提取的、由D-和L-半乳糖残基通过α和β糖苷键交替构成的线状聚合物。琼脂糖链形成螺旋纤维,然后再聚合成半径为20-30nm的超螺旋结构。干的琼脂糖悬浮于缓冲液中,加热煮沸变为澄清45℃开始形成多孔性刚性滤孔并凝聚,即成琼脂糖凝胶。凝胶孔径的大小决定于琼脂糖的浓度,低浓度的琼脂糖形成较大的孔径,而高浓度的琼脂糖形成较小的孔径
➢ 琼脂糖是从海藻中提取的、由D-和 L-半乳糖残基通 过α和β糖苷键交替构成的线状聚合物。琼脂糖链形 成螺旋纤维,然后再聚合成半径为20-30nm的超螺 旋结构。 干的琼脂糖悬浮于缓冲液中,加热煮沸变为澄清, 45℃ 开始形成多孔性刚性滤孔并凝聚,即成琼脂糖 凝胶。凝胶孔径的大小决定于琼脂糖的浓度,低浓度 的琼脂糖形成较大的孔径,而高浓度的琼脂糖形成 较小的孔径
2.原理DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和分子筛效应。DNA分子在高于等电点的pH溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。由于糖-磷酸骨架在结构上的重复性质,相同数量的双连DNA几乎具有等量净电荷,因此它们能以同样的速度向正极方向移动。在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应,即DNA分子本身的大小和构型
2. 原理 DNA 分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和 分子筛效应。DNA 分子在高于等电点的pH 溶液 中带负电荷,在电场中向正极移动。由于糖-磷酸 骨架在结构上的重复性质,相同数量的双涟DNA 几乎具有等量净电荷,因此它们能以同样的速度 向正极方向移动。在一定的电场强度下,DNA 分子的迁移速度取决于分子筛效应,即DNA 分 子本身的大小和构型
DNAfragmentsGelparticlePore
琼脂糖凝胶的浓度与DNA分离范围琼脂糖浓度(%)线型DNA分子的分离范围(Kb)0.35~ 600.61~200.70.8~100.90.5~71.20.9 ~ 61.50.2~312.00.1 ~ 2
琼脂糖凝胶的浓度与DNA分离范围 琼脂糖浓度(%) 线型DNA分子的分离范围(Kb) 0.3 5~60 0.6 1~20 0.7 0.8~10 0.9 0.5~7 1.2 0.9~6 1.5 0.2~3 12.0 0.1~2
3.电泳缓冲液常用三种缓冲液:Tris-硼酸(TBE)、Tris-乙酸(TAE)、Tris-磷酸(TPE)TBE与TPE:缓冲容量高,DNA分离效果好,但TPE在DNA片段回收时含磷酸盐浓度高,容易使DNA沉淀TAE:缓冲容量低,但价格较便宜,因而推荐选用TAE。缓冲液中的EDTA可螯合二价阳离子,从而抑制DNA酶的活性,防止DNA降解
3.电泳缓冲液 常用三种缓冲液: Tris-硼酸(TBE)、Tris-乙酸(TAE)、Tris-磷酸 (TPE) ⚫ TBE与TPE:缓冲容量高,DNA分离效果好,但 TPE在DNA片段回收时含磷酸盐浓度高,容易使 DNA沉淀 ⚫ TAE:缓冲容量低,但价格较便宜,因而推荐选 用TAE。缓冲液中的 EDTA 可螯合二价阳离子, 从而抑制DNA酶的活性,防止DNA降解