第六章真核生物特殊的染色体制图技术 第一节制图函数 制图函数的概念 为什么使用制图函数? 1)只有在两个基因座距离较近时,才可以 使用以RF表示的图距。 2)在中等距离时开始出现双交换,这时图 距与RF已不成线性关系。 3)距离更远时,两基因座之间会出现多重 交换,这种非线性关系变得更加明显;呈现非连 锁状态。 在第2、3种情况需寻找一个或多个标记(为 发现双或多交换而寻找的居间基因实际操作 起来很困难 名词 制图函数( mapping function):以重组率为
第六章 真核生物特殊的染色体制图技术 第一节 制图函数 一、制图函数的概念 为什么使用制图函数？ 1)、只有在两个基因座距离较近时，才可以 使用以 RF 表示的图距。 2)、在中等距离时开始出现双交换，这时图 距与 RF 已不成线性关系。 3)、距离更远时，两基因座之间会出现多重 交换，这种非线性关系变得更加明显；呈现非连 锁状态。 在第 2、3 种情况需寻找一个或多个标记（为 发现双或多交换而寻找的居间基因）。实际操作 起来很困难。 名词 制图函数(mapping function)：以重组率为
自变量,图距为因变量所得到的函数。在这里只 需要重组率一个变量,并不需要考虑两基因座之 间是否存在双或多交换。 二、 Haldane制图函数 Haldane(霍尔丹)推导的重组率校正函数: RF=(1-e2)/2 x代表交换率,e是自然底数。 公式表示重组率与图距的关系。图距的单位 是1%交换率 RH 0.30 0.10 0.00 说明: 1)纵轴为重组率横轴为图距单位为p=100x
自变量，图距为因变量所得到的函数。在这里只 需要重组率一个变量，并不需要考虑两基因座之 间是否存在双或多交换。 二、Haldane 制图函数 Haldane(霍尔丹)推导的重组率校正函数： RF = (1 - e -2x) / 2 x 代表交换率，e 是自然底数。 公式表示重组率与图距的关系。图距的单位 是 1%交换率 说明： 1)．纵轴为重组率。横轴为图距，单位为 μ=100x
2)平均交换次数越多,基因座之间的距离越远 3)从上图的实线可以看出不论染色体上的两 个基因座相距有多远其RF值永不会大于50%。 当x→)∞时ex→0,这时RF→50% 4)从上图的虚线可以看出只有在μ值很小时 的一个很小区间内,图距才与RF呈线性关系, 斜率为1,重组率是加性的。这时的RF可直接 用来作为图距 5)交换次数很多时(曲线较大区域),斜率小 于1,重组率不再是加性的,RFac<RFb+RFbe 必须用制图函数加以校正 6)由RF=(1-e2)/2解出x x=ln(1-2RF)/2 由此得出 MD=-50 In(1-2RF)mu. 不管基因座之间的远近,该公式都是适用 的
2).平均交换次数越多，基因座之间的距离越远 3).从上图的实线可以看出，不论染色体上的两 个基因座相距有多远，其RF值永不会大于50%。 当 x→∞时 e -x→0，这时 RF→50% 4).从上图的虚线可以看出，只有在 μ 值很小时 的一个很小区间内，图距才与 RF 呈线性关系， 斜率为 1，重组率是加性的。这时的 RF 可直接 用来作为图距 5).交换次数很多时（曲线较大区域），斜率小 于 1，重组率不再是加性的，RFac<RFab+RFbc。 必须用制图函数加以校正 6).由 RF = (1 - e -2x) / 2 解出 x， x = -ln (1 - 2RF ) / 2 由此得出： MD = -50 ln (1 – 2RF ) m.u. 不管基因座之间的远近，该公式都是适用 的
例 (1)已知RF=275%,问基因座之间的图 距是多少? MD=-50l(1-2RF)=-50lm0.45=40m.u 两基因座之间的距离是40mu.,若以RF 为图距,则低估基因座之间的真实距离。 (2)已知RF=4%,求图距。 MD=-50l(1-0.08)=4.2mu 第二节四分子分析 几个概念 粗糙链霉菌( Neurospora crassa)是遗传分析 的好材料:
例 （1）已知 RF = 27.5%，问基因座之间的图 距是多少？ MD = -50 ln (1- 2RF) = -50 ln 0.45 = 40 m.u. 两基因座之间的距离是 40 m.u.，若以 RF 为图距，则低估基因座之间的真实距离。 （2）已知 RF= 4%，求图距。 MD = -50 ln (1- 0.08) = 4.2 m.u. 第二节 四分子分析 一、几个概念 粗糙链霉菌(Neurospora crassa)是遗传分析 的好材料：
Fertilzation (2n Aa 一 Asexual spore Meis gure 6.20 Life cyde d Neurospora A and a are mating tpes; n is a haplo stage; 2n (1)个体小,生长快,易于培养,数量多。 (2)它的染色体结构和功能类似于高等动 植物,且能进行有性生殖 (3)是单倍体,没有显隐性的问题,基因 型直接在表现型上反映出来。 (4)一次只分析一个减数分裂的产物,手 续简便。一般的二倍体生物的合子是父母本两个 不同减数分裂产生的孢子相互结合的产物,不易 分析,测交的目的就是每次只研究一个减数分裂
（1）个体小，生长快，易于培养，数量多。 （2）它的染色体结构和功能类似于高等动 植物，且能进行有性生殖。 （3）是单倍体，没有显隐性的问题，基因 型直接在表现型上反映出来。 （4）一次只分析一个减数分裂的产物，手 续简便。一般的二倍体生物的合子是父母本两个 不同减数分裂产生的孢子相互结合的产物，不易 分析，测交的目的就是每次只研究一个减数分裂