连续性 蒹并性 在不同生物中使用同义密码子的频率是不相同 的偏爱密码 摆动配对(变偶现象) 通用性 线粒体的密码有一定的差别 AUG起始密码和甲硫氨酸 UAG、UAA、UGA-终止密码
密码的特点 • 连续性 • 兼并性 在不同生物中使用同义密码子的频率是不相同 的——偏爱密码 • 摆动配对（变偶现象） • 通用性 – 线粒体的密码有一定的差别 – AUG—起始密码和甲硫氨酸 – UAG、UAA、UGA—终止密码
起始密码 Initiation codon) AUG 终止密码 (termination codons) UAA(琥珀 amber) UAG(赭石 ochre) UGA(蛋自石opa)
硒半胱氨酸是大肠杄菌的第21个拥有密码子 的氨基酸(识别UGA) Coo HaN—CH CHa 高浓度时取代 在同买Se 验中 Selenocysteine
硒半胱氨酸是大肠杆菌的第21个拥有密码子 的氨基酸（识别UGA） 高浓度时取代 正常Cys，用 在同步辐射实 验中
从蛋白质化学的角度看, 遗传名码已经得到优化 1.4835E 57120D 2.57731 1598 0.D2798% 现有密码子 氨基酸的突变从其 的计算值 疏水指数的变化对 蛋白质的构象的影 响来看密码子的进 化程度。J.Mol.Evol (2003)57:533-537 5712000 1.4835E 1.120E7 3.9159E 影响小 影响大
从蛋白质化学的角度看, 遗传密码已经得到优化 影响小 影响大 氨基酸的突变从其 疏水指数的变化对 蛋白质的构象的影 响来看密码子的进 化程度。J. Mol. Evol (2003) 57: 533–537. 现有密码子 的计算值
氨基酸的亲疏水性指数 (hydropathic index) y Table 13.1 Hydrophobicity scales acid Phe Met lle Leu Val Cys Trp Ala Thr Gly Ser Pro Tyr His GIn AsH■國s豳 2.81.94.53.84.22.5-091.8-0.7-0.4-0.8-1.6-1.3-3.2-3.5-3.53.5-3.9-3.5-4.5 B3.73.43.|282.62.0191.61.21.00.6-0.2-0.7-3.0-4.1-488.2-88-92-12.3 Row A is from J. Kyte and R F. Doolittle: row B, from D A Engelman, T A Steitz, and A Goldman 可以用来指示肽链局部的亲疏水程度 以预测它在蛋白质的内部还是外部
氨基酸的亲疏水性指数 （hydropathic index） 可以用来指示肽链局部的亲疏水程度， 以预测它在蛋白质的内部还是外部