关键科学问题: 重要功能蛋白质含量低重要功能蛋白质存在翻译后修饰 质谱分析技术 巨大挑战 肿瘤特异性标志物 解决问题的关键: 发展更灵敏的质谱分析技术 低含量蛋白质 发展更特异的质谱分析技术 化学修饰蛋白质
16 解决问题的关键： 发展更灵敏的质谱分析技术 低含量蛋白质 发展更特异的质谱分析技术 化学修饰蛋白质 关键科学问题： 重要功能蛋白质含量低 巨大挑战 肿瘤特异性标志物 重要功能蛋白质存在翻译后修饰 质谱分析技术
瞄准的研究对象: 美国FDA批准的仅有的17个肿瘤蛋白质标志物 7个存在磷酸化,13个存在糖基化 糖基化 1/2的蛋白存在糖基化修饰 蛋白质 低含量 交互作用 蛋白质 磷酸化 蛋白质13的蛋白存在磷酸化修饰 Joseph A Ludwig et al, Nature, 2005, 5, 845 Apweiler R, Cell, 2004, 117, 699
Apweiler R，Cell, 2004, 117，699 低含量 蛋白质 糖基化 蛋白质 磷酸化 蛋白质 1/2 的蛋白存在糖基化修饰 1/3 的蛋白存在磷酸化修饰 交互作用 Joseph A. Ludwig et al, Nature, 2005, 5, 845 美国FDA批准的仅有的17个肿瘤蛋白质标志物 7个存在磷酸化，13个存在糖基化 瞄准的研究对象： 17
Anal chen.2006.78.801 份析蛋白质的流租 Mol Bio Syst, 2010, 6, 1447 Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 3345 Angew Chem Int Ed, 2008, 47, 4204 n Anal Chem, 2008, 80, 6758 酶解 Chem Commun. 2007. 4468 Proteomics, 2007.7 2497 糖基化肽 段特异性 质低磷酸化肽段 富集 含特异性富集 Anal chem,2008,80,8324 Ana.chem.2009,81,503 Mol Cell Proteomics, 2008, 7, 2073 chem-EurJ,2009,15,10158 Proteomics, 2009, 9, 4093 Chem-Asian J 2010. 5. 1185 Mol Cell Proteomics, 2010, M110.000117 Proteomics, 2010. 10, 1079 LC-MS LC-MS J Proteome res, 2010.9 227 质谱分析 标志物研究 J Proteome res. 2010.9 4701
酶解 糖基化肽 段特异性 富集 磷酸化肽段 特异性富集 LC‐MS LC‐MS 低含量蛋白质 糖基化蛋白质 磷酸化蛋白质 质富集除盐 低含量蛋白 LC‐MS LC‐MS 质谱分析 标志物研究 质谱大规模分析蛋白质的流程 Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 3345 Angew Chem Int Ed, 2008, 47, 4204 Anal Chem, 2008, 80, 6758 Chem. Commun., 2007, 4468 Proteomics，2007, 7, 2497 Anal Chem, 2008, 80, 8324 Mol Cell Proteomics, 2008, 7, 2073 Proteomics, 2009, 9, 4093 Mol Cell Proteomics, 2010,M110.000117 Anal. Chem. 2009, 81, 503 Chem-Eur J, 2009, 15, 10158 Chem-Asian J, 2010, 5, 1185 Proteomics, 2010, 10，1079 J Proteome Res, 2010, 9, 227 Anal Chem, 2006, 78, 801 Mol BioSyst, 2010, 6, 1447 J Proteome Res, 2010, 9, 4701
1.建立了复合材料富集低含量蛋白质的质谱分析新方法 低含量蛋白质意义:挖掘肿瘤更特异标志物的宝库 低含量蛋白质的质谱分析存在的问题 达不到最低检测量 低含量蛋白质 耐盐性差 分析重复性差
低含量蛋白质的质谱分析存在的问题 低含量蛋白质 达不到最低检测量 分析重复性差 耐盐性差 19 1.建立了复合材料富集低含量蛋白质的质谱分析新方法 低含量蛋白质意义：挖掘肿瘤更特异标志物的宝库
1.建立了复合材料富集低含量蛋白质的质谱分析新方法 我们的策略 超低浓度样品<pM 核壳纳米材料富 集除盐新方法 质谱高灵 敏高重复 小体积低浓度样品 嵌段聚合物靶上原 性分析 ~1μl,<nM 位富集除盐新方法 Anal chem,2008,80,6758 Angew Chem Int Ed 2006. 45. 3345 Proteomics, 2007.7, 2497 Angew Chem Int Ed, 2008, 47, 4204 Chem Commun 2007 4468
我们的策略 20 1.建立了复合材料富集低含量蛋白质的质谱分析新方法 小体积低浓度样品 ~ 1 μl，< nM 超低浓度样品< pM 嵌段聚合物靶上原 位富集除盐新方法 核壳纳米材料富 集除盐新方法 质谱高灵 敏高重复 性分析 Anal Chem, 2008, 80, 6758 Proteomics，2007, 7, 2497 Angew Chem Int Ed 2006, 45, 3345 Angew Chem Int Ed, 2008, 47, 4204 Chem Commun, 2007, 4468