Woese用寡核苷酸序列编目分析法对60多株细菌的 16 6SrRNA序列进行比较后,发现:产甲烷细菌完全没有 作为细菌特征的那些序列,于是提出了生命的第三种形 式--古细菌(archaebacteria) 古细菌原界:产甲烷菌;极端嗜盐,热和酸菌 真细菌原界(Eubacteria)原核生物; 真核生物原界(Eukaryotes):真菌;原生动物;植物和动物

R.H. Whitakker Science 163: 150-160.1969 原核生物界 Monera:细菌、放线菌等 原生生物界 Protista:藻类、原生动物、粘菌等 真菌界 Fungi:酵母、霉菌

两界学说:植物界和动物界 五界学说:动物界;植物界;原生生物界;真菌界和原核生 物界.五界系统是以细胞结构分化的等级以及和光 合、吸收、摄食这三种主要营养方式有关的组织 类型为基础的

微生物学的研究对象和任务 什么是微生物?非分类学上名词,来自法语 “Microbe”一词。形体微小、单细胞或个体结构简单的多细胞、甚或无细胞结构的低等生物的通称等原核类:细菌放线菌,蓝藻等微

一、微生物学的研究对象和任务 二、微生物在生物界中的地位 三、人类对微生物世界的认识史 四、微生物学的发展促进了人类的进步 五、微生物的五大共性

附录1词汇表 al gori thm(算法):为完成一个特定任务而进行的一系列动作(例如,一些计算步骤) browser(浏览器):用来访问万维网的程序,超文本标识语言(HTM)使得浏览器可以在 不同的计算机平台上以相同的方式来显示一个网页。 characters and character states(特性及状态):在系统发生学中,特性指不同物种之 间的同源的特征。这些特征在某个个体上的具体表现称为状态。例如,对于“发色”,可以 有“金色”,“红色”,“黄色”等几种状态。在分子生物学中,状态可以是4种核苷酸 (A,T,C,G)之一,或20种氨基酸之一。也有一些作者将” character”定义为状态。 client(客户端):与远端计算机(服务器)交互的一台计算机或计算机上运行的软件

随着人类基因组计划的实施,通过基因组测序,蛋白质序列测定结构解析等实 验,分子生物学家提供了大量的有关生物分子的原始数据,需要利用现代计算技 术对这些原始数据进行收集、整理、管理以便于检索使用。而为了解释和理解这 些数据,还需要对数据进行比对、分析,建立计算模型,进行仿真、预测与验 证,因而出现生物信息学,它的出现,极大的促进了分子生物学的发展

实用指南 辑 Andreas d. Baxevanis enome Technology Branch National human genome research Institute National Institutes of health Bethesda, Maryland B. F Francis ouellette National Center for Biotechnology Information National Institute of health ADB将本书奉献给他的母亲 Anastasia,并纪念他的父亲 Demetrios,他们的智慧和爱是守护 他一生的力量

一、引言 快速、经济的核酸序列测序方法的出现使包括分子生物学、遗传学以及生物化学在内的许多 科学领域发生了革命。(Gi bert,1981: Sanger,1981)这项技术的发展同时也使人们需 要构建公用数据库来存储在全世界范围的实验室内得到的序列信息(Benson et al.1997 Stoesser et al.1997)。由于提交到数据库中的序列需要进行分析和解释,同时已经存在 的数据库中的条目需要进行辨识和修补以供研究人员进一步研究之用,因此随着公用数据库 的建立,生物信息学和计算生物学逐渐走向成熟

这一章讨论的是解释DNA序列的方法,这些方法主要依赖于功能模式的检测,而不是与其它单 个序列的比较。这些方法中的绝大部分意在先寻找并遮蔽重复的和低复杂性的序列,再寻找 基因以及与其相关的调控区域。在针对单个序列的集中调查分析,以及为可能的基因、整个 基因组或相应较大区域建立初步清单的快速扫描过程中,这些方法都发挥了主要作用