语言基础 生命科学学院 生物信息学实验室 冯聪 venison@zu.edu.cn 03/18, 2019 Hangzhou Ming Chen'4 Group of Bioinformatics e College of Life Sciences, Zhejiang University
生命科学学院 生物信息学实验室 冯聪 ventson@zju.edu.cn 03/18, 2019 Hangzhou
R语言简介 来源 ·R是S语言的一种实现。S语言是由AT&T贝尔实验室开发的种用 来进行数据挖掘、统计分析、作图的解释型语言。最初S语言的实 现版本主要是 S-PLUS。 S-PLUS是一个商业软件,它基于S语言 并由 MathS公司的统计科学部进一步完善。 ·1995年由新西兰 Auckland大学统计系的 Robert gentleman和 Ross Thaka,编写了一种能执行S语言的软件,并将该软件的源代 码全部公开,这就是R软件,其命令统称为R语言。 ·R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的 个自由、兔费、开源的软件,它是一个用丁统计计算和统计制图 的优秀工具。 R主页htt:www.r-proiectorg CRAN软件及安装包http://cran.r-proiect.org/mirrors.html
R语言简介 来源 • R是S语言的一种实现。S语言是由 AT&T贝尔实验室开发的一种用 来进行数据挖掘、统计分析、作图的解释型语言。最初S语言的实 现版本主要是S-PLUS。S-PLUS是一个商业软件,它基于S语言, 并由MathSoft公司的统计科学部进一步完善。 • 1995年由新西兰Auckland大学统计系的Robert Gentleman和 Ross Ihaka,编写了一种能执行S语言的软件,并将该软件的源代 码全部公开,这就是R软件,其命令统称为R语言。 • R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的 一个自由、免费、开源的软件,它是一个用于统计计算和统计制图 的优秀工具。 R主页 http://www.r-project.org/ CRAN(软件及安装包) http://cran.r-project.org/mirrors.html
R语言简介 R软件下载及安装 本次课程使用R软件版本为R-3.52 下载镜像-中国清华镜像网站 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/cran/ STudio Open source and enterprise-ready professional software for R
R语言简介 R软件下载及安装 本次课程使用R软件版本为R-3.5.2 下载镜像-中国清华镜像网站 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/
语言简介 控制台界面 蝙查看其他程序包窗口帮助 菜单栏 快捷按钮 RR Console R version3.3.1(2016-06-21) "Bug in Your Hair " Copyright (c)2016 The R Foundation for statistical Computing Platform: x86 64-w64-mingw32/x64 (64-bit) R是自由软件,不带任何担保 在某些条件下你可以将其自由散布。 用1 icense()·或1 cence()·来看散布的详细条件 R是个合作计划,有许多人为之做出了贡献 用' contributors()·来看合作者的详细情况 用 citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包 用'demo()·来看一些示范程序,用"he1p()·来阅读在线帮助文件,或 用"he1p. start()通过H浏览器来看帮助文件。 用q()·退出R 命令行
R语言简介 控制台界面 菜单栏 快捷按钮 命令行
R语言基本操作 R数据类型 基础数据类型 数值型 Numeric如100,0,-4.335 复数型comp1ex如1+2i 字符型 Character如 China 逻辑型 Logica1如TRUE, FALSE ·结构化数据 向量( vecto)一系列相同类型元素组成的一维数组;使用变量的时候要特 矩阵( matrix)矩阵是由相同类型元素组成的二维数组;别注意,R对大小写敏感! 数组(axay)数组与矩阵类似,但维度可以大于2; 变量不能以数字开始。 因子( factor)类别和有序类别型变量; 数据框 是由一个或几个向量和(或)因子构成,它们必须是等长的, (data. frame)但可以是不同的数据类型;(最常用) 列表(1ist)列表可以包含任何类型的对象
R语言基本操作 R数据类型 • 基础数据类型 • 结构化数据 数值型 Numeric 如 100, 0, -4.335 复数型 Complex 如 1+2i 字符型 Character 如 “China” 逻辑型 Logical 如 TRUE, FALSE 向量(vector) 一系列相同类型元素组成的一维数组; 矩阵(matrix) 矩阵是由相同类型元素组成的二维数组; 数组(array) 数组与矩阵类似,但维度可以大于2; 因子(factor) 类别和有序类别型变量; 数据框 是由一个或几个向量和(或)因子构成,它们必须是等长的, (data.frame) 但可以是不同的数据类型;(最常用) 列表(list) 列表可以包含任何类型的对象。 使用变量的时候要特 别注意,R对大小写敏感! 变量不能以数字开始