第七章个体遗传评定 —BLUP法简介 BLUP方法由美国学者 Henderson于1948年提出 20世纪80年代,随着数理统计学尤其是线性模型理 论、计算机科学、计算数学等多学科领域的迅速发展, BLP法在估计家畜育种值方面得到了广泛应用 特别是在大家畜的种用价值评定方面,BLUP法为重 要经济性状的遗传改良作出了重大贡献
第七章 个体遗传评定 ——BLUP法简介 • BLUP方法由美国学者Henderson于1948年提出 • 20世纪80年代,随着数理统计学尤其是线性模型理 论、计算机科学、计算数学等多学科领域的迅速发展, BLUP法在估计家畜育种值方面得到了广泛应用 • 特别是在大家畜的种用价值评定方面, BLUP法为重 要经济性状的遗传改良作出了重大贡献
、BLUP的概念及数学模型 (一)BLUP的概念 BLUP-Best Linear Unbiased prediction 偏预测:按照最佳线性无偏的原则去估 计线性模型中的固定效应和随机效应。 线性是指估计值是观测值的线性函数; 无偏是指估计值的数学期望等于被估计量的真实值(固 定效应)或被估计量的数学期望(随机效应); 最佳是指估计值的误差方差最小
一、BLUP的概念及数学模型 (一)BLUP的概念 BLUP——Best Linear Unbiased Prediction 最佳线性无偏预测:按照最佳线性无偏的原则去估 计线性模型中的固定效应和随机效应。 线性是指估计值是观测值的线性函数; 无偏是指估计值的数学期望等于被估计量的真实值(固 定效应)或被估计量的数学期望(随机效应); 最佳是指估计值的误差方差最小
(二)BLUP的数学模型 口模型(Mode) υ模型是描述观察值与影响观察值变异性的各因子之间的 关系的数学方 分类 ■真实模型——非常准确地模拟观察值的变异性, 模型中不含有未知成分 理想模型——根据研究者所掌握的专业知识建立 的尽可能接近真实模型的模型 操作模型——用于实际统计分析的模型,它通常 是理想模型的简化形式
(二)BLUP的数学模型 模型(Model) 模型是描述观察值与影响观察值变异性的各因子之间的 关系的数学方程式 分类 真实模型——非常准确地模拟观察值的变异性, 模型中不含有未知成分 理想模型——根据研究者所掌握的专业知识建立 的尽可能接近真实模型的模型 操作模型——用于实际统计分析的模型,它通常 是理想模型的简化形式
BLUP方法所用数学模型为线性模型 —模型中所包含的各因子是以相加的形式影响观 察值,相互间呈线性相关。 ■一个线性模型应由3个部分组成: 数学方程式 方程中随机变量的期望方差和协方差 假设及约束条件
BLUP方法所用数学模型为线性模型 ——模型中所包含的各因子是以相加的形式影响观 察值,相互间呈线性相关。 一个线性模型应由3个部分组成: 数学方程式 方程中随机变量的期望方差和协方差 假设及约束条件
线性模型举例 母牛的乳脂量生产成绩表( Schaeffer,1993) 初产年龄(等级) 分组 2 3 114 143 145 150 犊季节 109 103 163 117 n数学方程式yk=H+a1+b+em 期望和方差:E(y)=+a1+bE(en)=0(ym)=(en)=口2 假设和约束条件: 所有母牛都来自同一品种 所有母牛都在相同的环境下以相同的饲养方式饲养 °所有的母牛都来自同一公牛 °所有的母牛的母亲对母牛的乳脂量无影响
数学方程式: 期望和方差: 假设和约束条件: 所有母牛都来自同一品种 所有母牛都在相同的环境下以相同的饲养方式饲养 所有的母牛都来自同一公牛 所有的母牛的母亲对母牛的乳脂量无影响…… 分组 初产年龄(等级) 1 2 3 产 犊 季 节 1 114 143 145 150 2 109 103 163 117 yijk = + ai + bj + eijk 线性模型举例 母牛的乳脂量生产成绩表(Schaeffer L R,1993) ijk ai bj E( y ) = + + ( ) = 0 ijk E e 2 ( ) ( ) ijk ijk i V y =V e =