用家精品课程 第5章基因组序列-5.1物理作图 (3)作图文库的大小 0 插入片段的大小决定了基因组文库中包含基因组 的每一个序列所需的克隆数。 随着所要求基因组覆盖率的提高，所需的克隆数 相应地增加。 当覆盖率不变时，随着基因组的增大，所需的克 隆数也相应地增加。 21
遗传学 Genetics 国家精品课程 21 (3)作图文库的大小 插入片段的大小决定了基因组文库中包含基因组 的每一个序列所需的克隆数。 随着所要求基因组覆盖率的提高，所需的克隆数 相应地增加。 当覆盖率不变时，随着基因组的增大，所需的克 隆数也相应地增加。 第5章 基因组序列-5.1 物理作图
角家精品得程 YAC (700 kb) BAC (200 kb) 基因组大小(Mb) 单个基因组95%复盖率 单个基因组 95%复盖率 酵母 14 20 59 70 209 线虫 100 143 427 500 1496 果蝇 170 243 726 850 2545 鼠 3000 4286 12838 15000 44935 人类 3000 4286 12838 15000 44935 拟南芥 100 143 427 500 1496 玉米 2500 3572 10698 12500 37445 番茄 950 1357 4064 4750 14228 大麦 5300 7572 22681 26500 79386 水稻 450 643 1924 2250 6739 火炬松 20000 28571 85591 10000 299572 利用平均长度为700kb(YAC)和200kb (BAC)的插入子构建95%基因 组复盖率的物理图谱所需的克隆数（资料来源：LiuB.H.,1998) 22
遗传学 Genetics 国家精品课程 22 YAC (700 kb) BAC (200 kb) 基因组大小（Mb） 单个基因组 95%复盖率 单个基因组 95%复盖率 酵母 14 20 59 70 209 线虫 100 143 427 500 1496 果蝇 170 243 726 850 2545 鼠 3000 4286 12838 15000 44935 人类 3000 4286 12838 15000 44935 拟南芥 100 143 427 500 1496 玉米 2500 3572 10698 12500 37445 番茄 950 1357 4064 4750 14228 大麦 5300 7572 22681 26500 79386 水稻 450 643 1924 2250 6739 火炬松 20000 28571 85591 10000 299572 利用平均长度为700 kb (YAC)和200 kb (BAC)的插入子构建95%基因 组复盖率的物理图谱所需的克隆数(资料来源：Liu B.H., 1998)
用家精品课程 第5章基因组序列-5.1物理作图 5.1.2建立克隆的重叠群 物理作图的下一个目标是要确定作图文库中克隆 片段的排列顺序，途径是建立克隆的重叠群。 重叠群(contig):彼此可以通过末端的重叠序 列相互连接成连续的DNA长片段的一组克隆。 丰丰甘一丰主 23
遗传学 Genetics 国家精品课程 23 5.1.2 建立克隆的重叠群 物理作图的下一个目标是要确定作图文库中克隆 片段的排列顺序，途径是建立克隆的重叠群。 重叠群（contig） ：彼此可以通过末端的重叠序 列相互连接成连续的DNA长片段的一组克隆。 第5章 基因组序列-5.1 物理作图
角家精品得程 第5章基因组序列-5.1物理作图 (1)染色体步移(chromosome walking.) 选择已知位置的克隆作为探针，寻找基因组文库中 与其部分重叠的克隆。通过多次重复这一步骤，就可以 找出一个彼此重叠的、连续不断的克隆片段重叠群。 24
遗传学 Genetics 国家精品课程 24 (1)染色体步移（chromosome walking） 选择已知位置的克隆作为探针，寻找基因组文库中 与其部分重叠的克隆。通过多次重复这一步骤，就可以 找出一个彼此重叠的、连续不断的克隆片段重叠群。 第5章 基因组序列-5.1 物理作图
用家精品课程 重叠群的构建 基因组文库 染色体步移 A ●●● (a)以起始克隆 ●●●●●●●●●● A为探针，从基因 ●●●●9●● 组文库中筛选到 克隆B1和B2 B2 ●●● (b)以克隆B1和 B2为探针，从基 ●●●●0●●●●● 8880. 因组文库中筛选 到克隆C1和C2 B2 C2 25
遗传学 Genetics 国家精品课程 25 ••• ••••••• •••••••••• ••••••••••• •••••••••• ••••••• ••• ••• ••••••• •••••••••• ••••••••••• •••••••••• ••••••• ••• A A B1 B2 A C1 B1 C2 B2 （a）以起始克隆 A为探针，从基因 组文库中筛选到 克隆B1和B2 （b）以克隆B1和 B2为探针，从基 因组文库中筛选 到克隆C1和C2 重叠群的构建 基因组文库 染色体步移