分子标记的种类 Y RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism):限制性片段长度多态性 ySSR(Simple Sequence Repeat):简单重复序 列 Y RAPD (Random Amplified Polymorphism DNA):随机扩增多态性DNA Y AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism):扩增片段长度多态性 YSNP(single nucleotide polymorphism)单核 苷酸多态性 ●●●●●
分子标记的种类 RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism):限制性片段长度多态性 SSR(Simple Sequence Repeat):简单重复序 列 RAPD(Random Amplified Polymorphism DNA):随机扩增多态性DNA AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism ):扩增片段长度多态性 SNP(single nucleotide polymorphism)单核 苷酸多态性
DNA分子标记 利用分子标记的多态性可以检测品种基因组结 构的变异(DNA标记 结构变异) 通过对分子标记确定的遗传距离,进行主成、 份分析或聚类分析,可以研究种质的类群 (标记数据一遗传距离聚类分析 类群
DNA分子标记 ▪ 利用分子标记的多态性可以检测品种基因组结 构的变异 (DNA标记 结构变异) ▪ 通过对分子标记确定的遗传距离,进行主成、 份分析或聚类分析,可以研究种质的类群 (标记数据 遗传距离 聚类分析 类群)
12 4小6 分子标记(引物)电泳结果
分子标记(引物)电泳结果
鲁®回田%医咱回关闭@)?, C1 C2 C3 C4 C5 C6 C7 C8 C9 C10 201 bni8.453 umc32 41 phi072 500T 60 1000 0phi041 101 202 1017 302 phi049 51 Pha126 2四 101 phi056 g 6 701 phi057 多包 102 phi059 303 舒36 3的 phi021 52 phill3 phil19 902 bng1244 1 304 404 6码 umc59 phil25 23 bngl602 phi034 103 phi050 bng1439 503 phill5 phi026 703 bn19.44 35 phi022104 phi062 1 24 phi073 umc68 umc120 904 406 phi016 L的 36 bnl5.37 &▣ 65 04 905 bn.17105 1233 bnl6.16 bng1666 307 47 umc66 505 多00 906 umc67 206 nc003 308 40R phi092 ng278 phi070 hnll4.281006 phi035 705 umc80 907 bngl128107 phil01 bnl7.49 207 阿 3 409 5阿 dupssr29 hi085 706 208 phill6 8线 phil27 umc63 10 phi090 L链 310 6网 phi037 209 a▣bngk589 phi080 L网 phi076 50 phi015 phi0ll 1r umcl07 210 四 ,全屏显示 四 bn16.32 所用RFLP和SSR标记及其在玉米染色体上的位置(参考Maize DB,199) 关闭全屏显示C) 100个RFLP和SSR标记在玉米染色体上的位置
100个RFLP和SSR标记在玉米染色体上的位置
187个自交系的聚类分析 A类 B类 1.00 0.80 0.60 0.40 0.20 Lines ■PA PB ■LRC,Lvda Red Cob A B D ■BSSS ■Lan SPT,Sipingtou Xie et al,2008
187个自交系的聚类分析 A类 B类 Xie et al,2008