另一侧为小沟。在大沟中裸露的是碱基对 顶部的基团,这些基团在不同的碱基对 中排列的次序不同,也就制约了与之结 合的蛋白质因子结构。这些基团在4种碱 基对的顺序为: 大沟:A-T环氮,氨基,酮基小沟:A-T 环氮,酮基 T-A酮基,氨基,环氮 T-A酮基,环氨 G-C环氮,酮基,氨基 G-C环氨,氨基,酮基 C-G氨基,酮基,环氮 C-G酮基,氨基,环氮 可以看出,大沟中显示的信息明显多于小 沟,则蛋白质因子沿大沟所形成氢键的 专一性更强。而小沟则相对信息少
另一侧为小沟。在大沟中裸露的是碱基对 顶部的基团,这些基团在不同的碱基对 中排列的次序不同,也就制约了与之结 合的蛋白质因子结构。这些基团在4种碱 基对的顺序为: 大沟:A-T 环氮,氨基,酮基 小沟:A-T 环氮, 酮基 T-A 酮基,氨基,环氮 T-A 酮基, 环氮 G-C 环氮,酮基,氨基 G-C 环氮,氨基,酮基 C-G 氨基,酮基,环氮 C-G 酮基,氨基,环氮 可以看出,大沟中显示的信息明显多于小 沟,则蛋白质因子沿大沟所形成氢键的 专一性更强。而小沟则相对信息少
专一性较弱。当然,这并不意味着小沟对 DNA的功能并不重要。 三、DNA二级结构的多态性 除B-DNA外,人们还发现到了其它的、结构 参数有一定差异的双螺旋DNA,如A-DNA, Z-DNA等。这一现象称为DNA结构的多态 性(po l ymorph i sm)。产生的原因在于 多核苷酸链的骨架含有许多可转动的单 链,从而使糖环可采取不同的构象
专一性较弱。当然,这并不意味着小沟对 DNA的功能并不重要。 三、DNA二级结构的多态性 除B-DNA外,人们还发现到了其它的、结构 参数有一定差异的双螺旋DNA,如A-DNA, Z-DNA等。这一现象称为DNA结构的多态 性(polymorphism)。产生的原因在于 多核苷酸链的骨架含有许多可转动的单 链,从而使糖环可采取不同的构象
(一)A-DNA 当DNA钠盐纤维在相对湿度为92%时,所处 的状态为B-DNA。当DNA钠盐纤维相对湿 度为75%时所处的状态就叫A-DNA。A-DNA 所形成的右手螺旋比B-DNA较大且较平, 每旋转一圈的螺距为2.8nm,每圈包含11 个碱基对,直径为2.55nm,每对碱基转 角为33°,碱基平面与轴夹角为20°,这样 使A-DNA的大沟窄而极深,而小沟浅(图 2-5)。造成这些差异的原因是A-DNA中
(一)A-DNA 当DNA钠盐纤维在相对湿度为92%时,所处 的状态为B-DNA。当DNA钠盐纤维相对湿 度为75%时所处的状态就叫A-DNA。A-DNA 所形成的右手螺旋比B-DNA较大且较平, 每旋转一圈的螺距为2.8nm,每圈包含11 个碱基对,直径为2.55nm,每对碱基转 角为33º,碱基平面与轴夹角为20º,这样 使A-DNA的大沟窄而极深,而小沟浅(图 2-5)。造成这些差异的原因是A-DNA中
脱氧核糖残基折叠方式为C,'内折,而B DNA中则为C,′内折(图2-6) a.C(2)-内式 b.C(3)外式c.C(2)-内式C(3)-外式d.C(3)-内式 图图26脱氧核糖的一些构象 图2-6脱子氧核糖的一些构象 A-DNA双螺旋不仅限于在A-DNA分子中存 在,RNA的双股发夹结构及RNA-DNA杂 交产物也有类似于A-DNA的双螺旋。从 不少实验结果可以推断生物体内某些 DNA分子中可能存在A-DNA双螺旋片段
脱氧核糖残基折叠方式为C3 ′内折,而BDNA中则为 C2 ′内折(图2-6)。 A-DNA双螺旋不仅限于在A-DNA分子中存 在,RNA的双股发夹结构及RNA-DNA杂 交产物也有类似于A-DNA的双螺旋。从 不少实验结果可以推断生物体内某些 DNA分子中可能存在A-DNA双螺旋片段。 图图2-6 脱氧核糖的一些构象 图2-6 脱子氧核糖的一些构象
(二)Z-DNA 1979年,Rich等通过对人工合成的脱氧六 核苷酸dCGCGCG的X-射线晶体衍射分析, 发现两分子的上述片段以左手双螺旋结 构的形式存在于晶体中,其中碳与磷原 子相连成锯齿形(Zig-Zag),因此被命 名为Z-DNA。其主要特征为: (1)以二聚体dGC或dCG为一个单位,并由 6个这样的单位构成一个左手螺旋构象, 即每个螺旋包含12对碱基,螺距为4.5 nm,螺旋直径为1.8nm,整个分子显得细
(二)Z-DNA 1979年, Rich等通过对人工合成的脱氧六 核苷酸dCGCGCG的X–射线晶体衍射分析, 发现两分子的上述片段以左手双螺旋结 构的形式存在于晶体中,其中碳与磷原 子相连成锯齿形(Zig-Zag),因此被命 名为Z-DNA。其主要特征为: (1)以二聚体dGC或dCG为一个单位,并由 6个这样的单位构成一个左手螺旋构象, 即每个螺旋包含12对碱基,螺距为4.5 nm,螺旋直径为1.8nm,整个分子显得细